Las principales fuentes de financiamiento del Programa, especialmente en lo que se refiere a las becas de maestría y doctorado, son CAPES, CNPq, FAPESB y la propia UFBA. Además de estas becas, los/las profesores/as del Programa tienen proyectos que cuentan con becas de Iniciación Científica (PIBIC y Permanecer), junto con proyectos contemplados en la Convocatoria Universal del CNPq. Algunos/as de los/las docentes acreditados/as también poseen beca Pq (Beca de Investigador - CNPq).